Il Comitato scientifico fornisce agli organi della Fondazione l'orientamento scientifico nei vari settori d'intervento del Museo. 

Presidente
Mariagabriella Fornasiero | Geologa e paleontologa, conservatore presso il Museo di Geologia e Paleontologia dell'Università degli Studi di Padova

Raffaella Bernardi | Professoressa associata presso la Facoltà di Ingegneria della Libera Università di Bolzano

Nicola De Pisapia | Professore associato presso il Dipartimento di Psicologia e Scienze Cognitive dell’Università degli Studi di Trento  

Umberto Tecchiati | Professore associato presso il Dipartimento di Beni Culturali e Ambientali dell’Università degli Studi di Milano

Dino Zardi | Promotore del Festivalmeteorologia e già presidente del Comitato Scientifico della Fondazione, Professore ordinario presso il Dipartimento di Ingegneria Civile Ambientale e Meccanica dell'Università degli Studi di Trento